بموجب كتاب دولة رئيس الوزراء رقم 57/11/1/7185 تاريخ 31/7/1999 ، وبناءً على قرار مجلس إدارة سلطة المياه رقم (3) تاريخ 20/6/1999 ، تم تحديد أسعار بيع المياه المعالجة على النحو التالي :
1. تحديد سعر بيع المياه المعالجة التي تستعمل للري بواقع (10) عشرة فلسات للمتر المكعب الواحد .
2. تحديد سعر بيع المياه المعالجة التي تستعمل للغايات الصناعية بما فيها توليد الطاقة والتبريد بواقع (50) خمسين فلساً للمتر المكعب الواحد .
3. تكون المياه المعالجة المزودة لمشاريع الدراسات والأبحاث مجانية ، شريطة عدم زيادة الكمية في أي موقع عن (200) مئتي متر مكعب يومياً ، وأن يتم تزويد سلطة المياه بنتائج هذه الدراسات والأبحاث
4. اضافة ( 10 فلس/م3 من المياه المعالجة المضخوخة للمزارعين ) كأثمان طاقة كهربائية بموجب قرار مجلس ادارة سلطة المياه رقم (329) تاريخ 24/7/2007م .